Canine Medicine and Genetics

Table 2 Three-locus MHC haplotypes and their frequencies in the studied dog breeds and mixed-breed groups

From: No evidence of prenatal diversifying selection at locus or supertype levels in the dog MHC class II loci

DRB1	DQA1	DQB1	AH¹	AH²	CB¹	CB²	ECS²	GR²	ISD	KKH	KL	LW	NF²	RRB²	SA	SBT²
10301	00101	00802									0.28
00101	00101	00201	0.15		0.24	0.22			0.08					0.30	0.02	0.35
00101	00101	03601										0.12			0.02
00101	00101	03603										0.12
00103	00101	00201				0.06
00201	00901	00101		0.25									0.17
00601	005011	00701	0.17	0.25		0.01	1.00						0.08	0.18	0.05
00601	005011	02001						0.12					0.33
00901	00101	008011	0.32							0.42	0.03	0.47			0.02
010011	00201	01501				0.06
01101	00201	01303								0.04
01102	00201	01303							0.08
01201	00401	013017^a		0.33	0.51								0.19		0.01
01201	00401	01303						0.42
01301	00101	00201							0.19				0.04	0.25		0.46
01301	00601	02002													0.07
01501	00901	00101														0.19
01501	00601	02301	0.24			0.31		0.19	0.23	0.03			0.04
01501	00601	05701	0.03
01501	00601	00301							0.12
01501	00601	02201									0.30
01501	00601	02002				0.07
01501	00401	013017^a													0.03
01501	012011	03501													0.01
01501	00601	01101								0.18		0.09
01502	00601	02301									0.22	0.03
01503	00601	00301							0.08
01503	00601	02304								0.07
01801	00101	00802	0.03		0.24									0.14	0.07
02001	00401	01303						0.27		0.09			0.04	0.01	0.42
02301	00301	00501							0.23	0.18
03001	00601	00301											0.03
04001	01001	01901		0.17
07001	01801	05001	0.06
07401	005011	00701									0.16				0.02
07401	00101	00201													0.01
07601	00601	02301				0.25
07801	00401	01303													0.08
08001	00402	01303													0.01
09401	00101	008011										0.18
09501	00301	05401													0.05
09501	00101	008011													0.02
09501	00901	00101													0.02
09701	00601	02002													0.04
09801	00402	02301													0.01
		NA				0.02							0.08	0.12	0.01
		n	39	6	49	116	8	13	13	37	138	17	66	52	83	13

AH ¹ Alaskan Husky, AH ² Alaskan Husky, CB ¹ Mixed-breed, CB ² Mixed-breed, ECS ² English Cocker Spaniel, GR ² Golden Retriever, ISD Icelandic Sheepdog, KKH Kooikerhondje, KL Kromfohrlander, LW Lowchen, NF ² Newfoundland, RRB ² Rhodesian Ridgeback, SA Saluki, SBT ² Staffordshire Bull Terrier
n = number of individuals (all litter-parents combinations)
^a Duplicated DLA-DQB1 locus, alleles DLA-DQB1*01303 and DLA-DQB1*01701
¹ Rowan [35], ² Kennedy et al. [34]

Back to article page

ISSN: 2662-9380

Contact us

Submission enquiries: gerlene.escanilla@springernature.com
General enquiries: info@biomedcentral.com