Skip to main content

Table 2 Three-locus MHC haplotypes and their frequencies in the studied dog breeds and mixed-breed groups

From: No evidence of prenatal diversifying selection at locus or supertype levels in the dog MHC class II loci

DRB1 DQA1 DQB1 AH1 AH2 CB1 CB2 ECS2 GR2 ISD KKH KL LW NF2 RRB2 SA SBT2
10301 00101 00802          0.28      
00101 00101 00201 0.15   0.24 0.22    0.08      0.30 0.02 0.35
00101 00101 03601           0.12    0.02  
00101 00101 03603           0.12     
00103 00101 00201     0.06           
00201 00901 00101   0.25          0.17    
00601 005011 00701 0.17 0.25   0.01 1.00       0.08 0.18 0.05  
00601 005011 02001       0.12      0.33    
00901 00101 008011 0.32        0.42 0.03 0.47    0.02  
010011 00201 01501     0.06           
01101 00201 01303         0.04       
01102 00201 01303        0.08        
01201 00401 013017a   0.33 0.51         0.19   0.01  
01201 00401 01303       0.42         
01301 00101 00201        0.19     0.04 0.25   0.46
01301 00601 02002              0.07  
01501 00901 00101               0.19
01501 00601 02301 0.24    0.31   0.19 0.23 0.03    0.04    
01501 00601 05701 0.03              
01501 00601 00301        0.12        
01501 00601 02201          0.30      
01501 00601 02002     0.07           
01501 00401 013017a              0.03  
01501 012011 03501              0.01  
01501 00601 01101         0.18   0.09     
01502 00601 02301          0.22 0.03     
01503 00601 00301        0.08        
01503 00601 02304         0.07       
01801 00101 00802 0.03   0.24          0.14 0.07  
02001 00401 01303       0.27   0.09    0.04 0.01 0.42  
02301 00301 00501        0.23 0.18       
03001 00601 00301            0.03    
04001 01001 01901   0.17             
07001 01801 05001 0.06              
07401 005011 00701          0.16     0.02  
07401 00101 00201              0.01  
07601 00601 02301     0.25           
07801 00401 01303              0.08  
08001 00402 01303              0.01  
09401 00101 008011           0.18     
09501 00301 05401              0.05  
09501 00101 008011              0.02  
09501 00901 00101              0.02  
09701 00601 02002              0.04  
09801 00402 02301              0.01  
   NA     0.02        0.08 0.12 0.01  
   n 39 6 49 116 8 13 13 37 138 17 66 52 83 13
  1. AH 1 Alaskan Husky, AH 2 Alaskan Husky, CB 1 Mixed-breed, CB 2 Mixed-breed, ECS 2 English Cocker Spaniel, GR 2 Golden Retriever, ISD Icelandic Sheepdog, KKH Kooikerhondje, KL Kromfohrlander, LW Lowchen, NF 2 Newfoundland, RRB 2 Rhodesian Ridgeback, SA Saluki, SBT 2 Staffordshire Bull Terrier
  2. n = number of individuals (all litter-parents combinations)
  3. a Duplicated DLA-DQB1 locus, alleles DLA-DQB1*01303 and DLA-DQB1*01701
  4. 1 Rowan [35], 2 Kennedy et al. [34]