Skip to main content

Table 4 Comparison of GSTP1 promoter haplotype frequencies between different dog breeds

From: Single nucleotide polymorphisms and microsatellites in the canine glutathione S-transferase pi 1 (GSTP1) gene promoter

Haplotype All dogs Afg Bas Sib Chi Gre Box Lab Pem Bea Dob Gol Ger Poo
*1A (17) 0.257 0.200 0.000 1.000 0.300 0.071 0.932 0.125 0.100 0.115 0.000 0.300 0.545 0.045
*1A (18) 0.004 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
*1B (17) 0.086 0.000 0.000 0.000 0.000 0.286 0.023 0.125 0.000 0.231 0.000 0.000 0.091 0.045
*2A (16) 0.077 0.000 0.000 0.000 0.200 0.071 0.000 0.063 0.100 0.038 0.333 0.200 0.000 0.318
*2B(17) 0.013 0.000 0.000 0.000 0.100 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.045 0.000
*3A(11) 0.081 0.600 0.500 0.000 0.000 0.571 0.023 0.125 0.100 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
*5A(17) 0.011 0.000 0.000 0.000 0.100 0.000 0.000 0.000 0.000 0.077 0.000 0.000 0.000 0.000
*6A(16) 0.218 0.100 0.100 0.000 0.100 0.000 0.000 0.438 0.300 0.269 0.417 0.050 0.182 0.227
*6A(17) 0.027 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.136 0.000
*7A(16) 0.005 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
*8A(19) 0.013 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.318
*9A(16) 0.072 0.100 0.000 0.000 0.100 0.000 0.000 0.063 0.200 0.154 0.083 0.300 0.000 0.000
*10A(16) 0.040 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.063 0.000 0.077 0.167 0.000 0.000 0.000
Ĥ 0.860 0.644 0.756 0.000 0.911 0.626 0.133 0.803 0.889 0.853 0.741 0.809 0.672 0.777
  1. Only those haplotypes with frequencies higher than 0.01 are shown. Afg Afghan Hound, Bas Basenji, Sib Siberian Husky, Chi Chihuahua, Gre Greyhound, Box Boxer, Lab Labrador Retriever, Pem Pembroke Welsh Corgi, Bea Beagle, Dob Doberman Pinscher, Gol Golden Retriever, Ger German Shepherd, Poo Standard Poodle. Ĥ: Haplotype diversity shown in bold